Estimation fragmentaire de R0 par un modèle simple de SEIR. Application à COVID-19 dans les régions et départements français jusqu'au 30 juin 2020.

Résumé L'estimation de R0 , appelé " ratio de reproduction de base ", de la pandémie COVID-19 est particulièrement importante pour aider les décideurs à prendre les mesures de sauvegarde nécessaires pour protéger la population. Dans ce travail, nous examinons une méthode basée sur l'estimation successive de R0 sur 3 périodes non chevauchantes (avant le lockdown, pendant le lockdown et après). L'approche est basée sur une variante du modèle compartimental SEIR, simple mais flexible, qui permet d'exploiter le nombre d'individus récupérés qui sont rapportés dans la base de données quotidienne publiée par les agences sanitaires nationales. Les résultats de l'approche sont analysés à partir des données de la France, à deux niveaux de subdivisions géographiques, c'est-à-dire les 13 régions et les 96 départements qui composent le territoire métropolitain.